当时，国内政治局势波谲云诡，革命党人内部时常出现内讧，这让马应彪感到非常失望。一年之后，孙中山再任临时大总统，邀请马应彪担任要职，他执意不受，并引用孙氏《物质建设（实业计划）》中的这段话作为遁词：“中国富源之发展，已成为今日世界人类之至大问题，不独为中国之利害而已也。唯发展之权，操之在我则存，操之在人则亡。”从此，他的心思全部转移到实业上。
民国年间，以前一起革命的战友，不少都在政界飞黄腾达，马应彪对他们却一般都是无事不登三宝殿。对曾是战友的“南天王”陈济棠，只要触犯自己的为人处世规则，马应彪一样也是不假辞色。
有一次，平日笑口常开的他却冲天大怒，痛斥“南天王”陈济棠的哥哥陈维周，只因为后者触犯他一向坚守的原则。20世纪30年代，陈济棠在粤主政，他的哥哥陈维周租下广州先施第二街的仓库，用做经商储货。一开始，马应彪觉得那是正常生意，没有在意。一天，一位友人来访，无意中说道：“那个陈维周，明着是禁烟督办，私下里却是鸦片大王，他走私的鸦片就藏在你们公司广州二街的仓库里。”