7月16日，国民警卫队的舰只从海上炮击“自由塞浦路斯之声”电台所在地的帕福斯主教宅邸，又从陆路围攻帕福斯。马卡里奥斯决定逃亡海外，呼吁国际社会给予支持。英驻军司令部派出一架武装直升飞机，把他接到阿克罗蒂里军事基地，然后又由英皇家空军的飞机送到马耳他岛。政变领导人消灭马卡里奥斯总统的计划完全落空。
17日，国民警卫队占据帕福斯，并相继攻占塞岛其他主要城市，但零星的抵抗始终没有消失，斗争此起彼伏。大多数希族人仍拒绝承认桑普森政府的合法地位，出现了消极抵抗运动。
马卡里奥斯总统抵达伦敦后，积极从事外交活动。事实上，他在争取国际支持方面获得很大的成功，除了希腊军政府外，均宣布拒绝承认塞浦路斯的政变当局。各大国均谴责希腊干预塞浦路斯内政，要求希腊撤回其在国民警卫队的希腊军官。
土耳其军队的入侵
土族人一直反对任何塞、希合并的方案，因此反对国民警卫队发动的政变，拒绝承认桑普森“救国政府”。由于一部分政变部队对土族居住区进行骚扰，甚至发生枪击土族人和抢劫土族人财产的行为，引起土族人的恐慌，出现了土族武装力量与国民警卫队交火的事件，但土族方面处于劣势。因此，塞土族人向土耳其政府请求派兵保护。土耳其对塞岛历来十分注意，特别是其在东地中海的战略地位，坚决反对希腊对塞岛的合并。当塞国民警卫队发动政变的消息传来后，土耳其总统召开内阁紧急会议，并命令土耳其军队进入戒备状态。与此同时，希腊武装部队也宣布进入紧急战备状态，一部分海军舰只已离港驶向塞浦路斯海面，这出现了希、土两国之间爆发战争的危机。