他后来又成为蒋介石的顾问，抗战军兴，他和宋美龄组建了外宣班子，撰写宣传信件。他因揭露南京大屠杀等日军暴行，被日本列入黑名单。
太平洋战争爆发，他从海外返回中国，不幸在菲律宾被日本人拘捕，机缘凑巧，竟未被发现真实身份。战后在珍珠港美国海军医院的病榻上，他口授往事及自己生平经历，友人录音、记录、整理，用以撰写端纳的传记。在谈话中，端纳发表了对中国时局的看法：马歇尔调停内战不会成功，国共双方势同水火，决不会和平共处……后来的政局发展果然印证了端纳的预见。
他对日本军国主义扩张的野心，很早就有认识，并谴责其侵略本质。他观察世界政治问题，具有独到的先见之明，日本人衔恨不已。他说：“当你和日本人打交道时，不论是商人还是外交官，你们做成的交易不会比同娼妓达成的交易好多少。娼妓可以答应给你欢乐，但她的吻会把你给毁了。”
他在西安事变中充当调停人。他的回忆强调几点，诸如：兵变是杨虎城发动的，张是替杨承担责任；亲日的军中暗流，又企图借机炸死蒋介石，趁乱夺取军政大权。端纳一再告诫张学良，此时若杀掉蒋介石，中国必然大乱，这只对日本有好处；张学良主动要求随蒋去南京，目的在于证明自己是出于爱国，指控他搞兵变和谋杀完全是无辜的。应该说眼光看深一层，颇为精警。